Las actividades de CITRUSEQ pretenden secuenciar al menos 30 especies, patrones y variedades de los géneros más importantes de cítricos, incluyendo representantes de sus grupos filogenéticos y comerciales, con el propósito de dilucidar las bases genéticas de la diversidad fenotípica y biológica de los cítricos.

Esta información de por sí, catalizará de una forma hasta hoy insospechada la generación de herramientas y conocimiento genético sobre los mecanismos de desarrollo de los cítricos, la resistencia a enfermedades, las respuestas a los estreses medioambientales, y asentará las bases para nuevos métodos de mejora de cítricos y la obtención de cultivos de comportamiento superior.

Otro aspecto relevante a destacar en el alcance del proyecto CITRUSEQ se centra en el genotipado de colecciones de cítricos. Después de caracterizar el nivel de polimorfismo en los cítricos se generarán chips para mapear estos SNPs en el germoplasma de los cítricos. La información derivada de este objetivo permitirá generar muy valiosos marcadores genéticos para desarrollar mapas de ligamiento, identificación de cultivares y estudios de diversidad genética con miras en la mejora.

En CITRUSEQ se pretende con la información disponible, y la incorporación de la nueva información conforme se obtenga, generar nuevas líneas de cítricos que tengan la esperanza de convertirse en variedades comerciales. Se utilizará la irradiación física y la generación de poblaciones segregantes.