SECUENCIACIÓN, GENOTIPADO Y DESARROLLO
DE HERRAMIENTAS GENÓMICAS PARA
LA MEJORA DE CÍTRICOS

ANECOOP
(Participante en los subproyectos 1, 4 y 5)

Anecoop es una empresa cooperativa líder en la comercialización de productos hortofrutícolas formada por más de un centenar de cooperativas pertenecientes a diversas comunidades autónomas. La empresa mantiene numerosas actividades relacionadas con la mejora varietal y el desarrollo de nuevas variedades acordes con las tendencias de los mercados. Para llevar a cabo estas acciones dispone de dos campos de ensayo destinados a la investigación y el desarrollo de mejores sistemas cultivo y nuevas variedades más acordes a la demanda actual: - Campo de experiencias Masía del Doctor, ubicado en la provincia de Valencia, con unas 20 has donde se reúnen colecciones varietales de distintos cultivos, cítricos, frutales, hortícolas, etc. con objeto de impulsar las actividades relacionadas con la mejora varietal y el desarrollo de nuevos productos adaptados a los gustos de los consumidores. - Campo de experiencias Fundación Universidad de Almería – Anecoop. Creado en el año 2004 para coordinar las actividades de investigación y experimentación de Anecoop y la Universidad de Almería. En 2008, le fue otorgada su catalogación como Agente Andaluz del Conocimiento en su modalidad de Centro de Innovación y Tecnología. El objetivo de la Fundación es contribuir a la modernización y mejora de la competitividad del sector agrario a través de la investigación, innovación y transferencia de tecnología hacia los productores agrícolas.

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
Ángel del Pino
Tel.: 96 393 85 00

adelpino@anecoop.com
www.anecoop.com

CENTRO DE INVESTIGACION PRINCIPE FELIPE
(Líder del subproyecto 2)

El CIPF posee uno de los grupos de investigación en bioinformática más grandes de España. El departamento de bioinformática está constituido por tres unidades, genómica funcional, genómica comparativa y de genómica estructural que mantienen un alto grado de interacción, lo que les permite abordar problemas complejos a nivel de genoma desde varias perspectivas. El departamento también sostiene el nodo de Genómica Funcional del Instituto de Bioinformática Nacional, liderado por J. Dopazo. El departamento también incluye el grupo de bioinformática del CIBERER (Center in Network for the Study of Rare Diseases) y cuatro de sus miembros participan en nuestros proyectos. El interés mayor del grupo es el estudio de los datos genómicos principalmente, los datos de expresión, polimorfismos, SNPs y el análisis funcional. Varios proyectos importantes como GEPAS (http://www.gepas.org) y Babelomics (http://www.babelomics.org), que constituyen dos paquetes de análisis funcional de microarrays, se han desarrollado en el seno de nuestro grupo. Estos dos paquetes bioinformáticos analizan una media de más de 500 experimentos diarios. Nuestro grupo también ha desarrollado nuevas herramientas para el análisis de los polimorfismos que se utilizan rutinariamente en el seno de la comunidad científica y en particular en el Spanish Genotyping Center (CeGen). La anotación funcional de nuevos genes constituye otro de los puntos fuertes del grupo. Así, hemos desarrollado una de las herramientas funcionales de anotación más importantes a nivel mundial, Blast2GO (http://www.blast2go.org). También se ha desarrollado en nuestro departamento herramientas para el análisis evolutivo como Phylemon (http://www.phylemon.org).

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
Joaquín Dopazo
Tel.: 96 328 96 80

jdopazo@cipf.es
www.cipf.es

EUROSEMILLAS
(Participante en los subproyectos 1, 4 y 5)

Eurosemillas, es una empresa líder en innovación vegetal cuya vocación es trabajar junto a expertos de reconocido prestigio para ofrecer nuevos modelos de desarrollo agroalimentario sostenible, a empresas agrícolas tradicionales. Eurosemillas es una empresa de referencia en el mundo rural comprometida con el Desarrollo Agrario de las zonas donde está implantada. Eurosemillas apoya la innovación para obtener resultados concretos a través de la investigación y el desarrollo.

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
José Pellicer
Tel.: 95 742 17 32

jpellicer@ieurosemillas.com
www.eurosemillas.com

FUNDACIÓN RURALCAJA VALENCIA
(Entidad representante del proyecto y líder del Subproyecto 6.
Participa en los subproyectos 1, 4 y 5)

Ruralcaja cuenta con cuatro Fundaciones ubicadas en Alicante, Elche, Castellón y Valencia. Ruralcaja trabaja diariamente por atender necesidades sociales puntuales a través de la realización de actividades dirigidas a todos los segmentos de la población, incluyendo los agricultores y los cooperativistas, para quienes se organizan distintas acciones culturales. Realizamos asimismo importantes acciones con el objeto de desarrollar y potenciar proyectos de interés económico y social de nuestro entorno. En este sentido, la obra social de Ruralcaja participa activamente en la investigación e innovación dentro del sector agrario, bien directamente o a través de la colaboración con instituciones públicas y privadas, como en este caso. En este proyecto, la Fundación Ruralcaja actúa como institución representante poniendo a disposición del consorcio de entidades que forman este proyecto su experiencia y capacidad administrativa. También desarrolla y lidera las tareas de difusión y oficina técnica.

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
Carlos Baixauli Soria
Tel.: 96 397 33 76

carlosbaixauli@grupcrm.es
www.ruralcaja.org

GCM, VARIEDADES VEGETALES, AIE
(Participante en los subproyectos 1, 4 y 5)

GCM Variedades Vegetales A.I.E, se constituye como empresa de I+D, para poder dar servicio en esta área a las empresas socias que la constituyen. Con la creación de GCM se pretende cubrir un área de investigación en cítricos que hasta el momento estaba desierta por el sector privado.

GCM Variedades vegetales tiene como actividad única la Investigación y Desarrollo en cítricos.

GCM se crea para facilitar el desarrollo o mejorar los resultados de la actividad de sus socios, especialmente en nuevos proyectos de investigación en búsqueda de nuevas variedades vegetales, especialmente de cítricos, para posibilitar y promover la actuación conjunta de los socios frente a terceros.

Las actividades de investigación que pretende realizar son:

:: Identificar las necesidades específicas de sus socios.
:: Optimizar el acceso de sus socios a nuevas variedades.
:: Adquirir derechos de producción de nuevas variedades.
:: Adquirir derechos de gestión de nuevas variedades.
:: Proporcionar prácticas específicas de producción de estas variedades.
:: Establecer alianzas con compañías similares.

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
Charo Marin
Tel.: 95 950 07 07

charomarin@gcmcitrus.com
www.gcmcitrus.com

ICC, S. A.
(Participante en los subproyectos 1, 4 y 5)

ICC, SA es una empresa de muy reciente creación orientada hacia la innovación e investigación en variedades de cítricos.

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
Juan Carlos Claramonte
Tel.: 96 434 23 90

claramonte-jc@claramonte.jazztel.es

INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGÍA DE SEVILLA
(Partipante en el subproyecto 3)

El Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla es un centro propio del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, que desarrolla actividades científicas básicas y aplicadas que persiguen un objetivo fundamental: la optimización del uso y conservación de los recursos naturales del suelo, agua y planta. Más concretamente, la actividad investigadora del IRNAS se centra en la sostenibilidad de la agricultura, su diversificación y mejora en la calidad de la producción. El Dr. Colmenero-Flores ha desarrollado una amplia experiencia en el estudio de la resistencia de las plantas, principalmente los cítricos a los estreses medioambientales. El Dr. Colmenero-Flores está especializado en la tolerancia a situaciones de salinidad, estrés hídrico y oxidativo. También ha centrado su actividad en la obtención de plantas mejor adaptadas al medio. El investigador, en los últimos años, ha estudiado los mecanismos celulares del desequilibrio iónico provocado por un medio salinizado por cloruro, que afecta especialmente a los cítricos, identificando los elementos que participan en la percepción del estrés iónico y en la respuesta adaptativa para el restablecimiento de la homeostasis iónica celular.

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
José Manuel Colmenero Flores
Tel.: 95 462 47 11

chemacf@irnase.csic.es
www.irnase.csic.es

INSTITUTO VALENCIANO
DE INVESTIGACIONES AGRARIAS (IVIA)
(Coordinador del proyecto y líder de los subproyectos 1, 3, 4 y 5.
Participa en el Subproyecto 6)

El equipo del IVIA ha estado implicado en la generación, caracterización fenotípica y análisis transcriptómico de mutantes de clementina, genotipos poliploides y variedades de cítricos. Los métodos más importantes desarrollados por este equipo son: rastreo de mutantes, chips de cDNA, determinaciones de metabolitos como hormonas, carotenoides y vitaminas, programas bioinformáticos para análisis de datos de chips, generación e integración de bases de datos, búsqueda de genes candidatos, PCR en tiempo real, clonaje y secuenciación de genes, ecotilling, HPLC desnaturalizante, ensayos de expresión transitoria, transformación genética de cítricos, expresión heteróloga y selección de genotipos. El equipo ha construido una librería normalizada y de longitud completa de cDNA de Clementina y ha secuenciado 42000 clones. Este set de transcriptos ha proporcionado más de 8000 secuencias de longitud completa y ha identificado más de 12000 genes. Además se han construido tres librerías BAC de DNA genómico de alto peso molecular a partir de hojas de Clementina. El tamaño del inserto osciló entre 50 y 240 kb, con un tamaño medio de 125 kb. El IVIA también maneja varias poblaciones segregantes de Clementina y de patrones. En el área de la genética el IVIA desarrolla y usa numerosas herramientas genómicas y biotecnológicas para la mejora de los cítricos y la caracterización de variedades.

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
Manuel Talón Cubillos
Tel.: 96 342 40 38

talon_man@gva.es
www.ivia.es

SNFL (Special New Fruit Licensing Mediterráneo S.L)
(Participante en los subproyectos 1, 4 y 5) SNFL (Special New Fruit Licensing)

SNFL es una empresa especializada en el desarrollo y la comercialización de nuevas variedades de uva de mesa y cítricos. Con sedes en Inglaterra (SNFL Ltd) y en España (SNFL Mediterráneo S.L – Source Citrus Genesis S.L) y copropietaria de Sheehan Genetics LLC en California y Vitis Ltd en Sud África. Los objetivos principales de la empresa son los siguientes:

::		Desarrollar y llevar nuevas y mejores variedades al mercado, de una manera rápida que beneficie a los clientes, productores y obtentores.
::		Financiar el trabajo del obtentor desde el principio al final del proceso y desarrollar una base de productores para las mejores variedades.
::		Facilitar a nuestros mejores productores el acceso a las mejores variedades.
::		Desarrollar una línea de suministro para las nuevas variedades que beneficie a todos los participantes – obtentor, productores y supermercados.

DATOS DE CONTACTO

Persona de contacto:
Josep Estiarte
Tel.: 96 827 82 00

josep.estiarte@snfl.co.uk
www.snfl.eu